High levels of antimicrobial resistance in Escherichia coli and Salmonella from poultry in Ecuador / Niveles elevados de resistencia antimicrobiana de las bacterias Escherichia coli y Salmonella en aves de corral en Ecuador / Altos níveis de resistência aos antimicrobianos em Escherichia coli e Salmonella de aves de criação no Equador

ABSTRACT Objective. To describe antimicrobial resistance profiles of Escherichia coli and Salmonella spp. isolated from chicken carcasses and the antimicrobials commonly used in animals in Ecuador and provide information on antimicrobial resistance patterns for implementing evidence-based corrective measures. Methods. Meat samples were collected from chicken carcasses in 199 slaughterhouses across Ecuador as part of a national pilot study for monitoring antimicrobial resistance in agricultural sources in 2019. Samples were tested for E. coli and Salmonella spp. Sensitivity to 10 critically important and three highly important antimicrobials (from a human health perspective) was assessed. The country report submitted to the World Organization for Animal Health was accessed to extract the quantity of antimicrobials produced or imported for use in animals. Results. Of 383 samples, E. coli was isolated from 148 (39%) and Salmonella spp. from 20 (5%) samples. Ninety percent of the isolates were resistant to at least one critically important antimicrobial. Resistance was highest to erythromycin (E. coli 76%; Salmonella spp. 85%) and tetracycline (E. coli 71%; Salmonella spp. 90%). Critically or highly important antimicrobials (colistin, tetracycline, trimethoprim/sulfamethoxazole) formed the bulk (87%) of antimicrobials used in animals as per the World Organization for Animal Health report. Conclusions. High prevalence of antimicrobial resistance in poultry in Ecuador calls for the development of guidelines and regulations on the use of antimicrobials and for engagement with livestock producers. The existing surveillance system needs to be strengthened to improve the monitoring of antimicrobial use and evolving resistance patterns.

RESUMEN Objetivo. Describir los perfiles de resistencia antimicrobiana de las bacterias Escherichia coli y Salmonella spp. aisladas en carne de pollo y los antimicrobianos comúnmente empleados en animales en Ecuador, así como proporcionar información sobre los patrones de resistencia a los antimicrobianos para poner en marcha medidas correctivas basadas en la evidencia. Métodos. Se recogieron muestras de carne de pollo en 199 mataderos de todo Ecuador en el marco de un estudio piloto nacional para monitorear la resistencia a los antimicrobianos en fuentes agrícolas en el 2019. Se analizaron las muestras en busca de E. coli y Salmonella spp. Se evaluó la sensibilidad a diez antimicrobianos de importancia crítica y tres muy importantes (para la salud humana). Se accedió al informe de país presentado ante la Organización Mundial de Sanidad Animal para obtener la cantidad de antimicrobianos producidos o importados para su uso en animales. Resultados. De 383 muestras, se aisló E. coli en 148 (39%) y Salmonella spp. en 20 (5%). En total, 90% de las cepas aisladas fueron resistentes a al menos un antimicrobiano de importancia crítica. Hubo una mayor resistencia a la eritromicina (E. coli: 76%; Salmonella spp.: 85%) y a la tetraciclina (E. coli: 71%; Salmonella spp.: 90%). Los antimicrobianos de importancia crítica o muy importantes (colistina, tetraciclina, trimetoprima/sulfametoxazol) constituyeron la mayor parte (87%) de los antimicrobianos empleados en animales según el informe de la Organización Mundial de Sanidad Animal. Conclusiones. Debido a la alta prevalencia de la resistencia a los antimicrobianos en las aves de corral en Ecuador, son imprescindibles la elaboración de directrices y regulaciones sobre el uso de antimicrobianos y el compromiso con los productores pecuarios. Es necesario fortalecer el sistema de vigilancia existente para mejorar el seguimiento del uso de antimicrobianos y de la evolución de los patrones de resistencia.

RESUMO Objetivo. Descrever perfis de resistência aos antimicrobianos em Escherichia coli e Salmonella spp. isoladas de carcaças de frango e os antimicrobianos comumente usados em animais no Equador e fornecer informações sobre padrões de resistência aos antimicrobianos para implementar medidas corretivas baseadas em evidências. Métodos. Foram coletadas amostras de carne de carcaças de frango em 199 abatedouros em todo o Equador como parte de um estudo piloto nacional para monitorar a resistência aos antimicrobianos de origem agrícola em 2019. Foram testadas amostras de E. coli e Salmonella spp. Foi avaliada a sensibilidade a 10 agentes antimicrobianos de importância crítica e três agentes antimicrobianos muito importantes (do ponto de vista da saúde humana). O relatório do país apresentado à Organização Mundial de Saúde Animal foi acessado para extrair a quantidade de antimicrobianos produzidos ou importados para uso em animais. Resultados. De 383 amostras, E. coli foi isolada em 148 (39%) e Salmonella spp. em 20 (5%). Noventa por cento dos isolados foram resistentes a pelo menos um antimicrobiano de importância crítica. A resistência foi maior à eritromicina (E. coli, 76%; Salmonella spp., 85%) e à tetraciclina (E. coli, 71%; Salmonella spp., 90%). Antimicrobianos de importância crítica ou muito importantes (colistina, tetraciclina, trimetoprim/sulfametoxazol) responderam pela maior parte (87%) dos antimicrobianos utilizados em animais, conforme o relatório da Organização Mundial de Saúde Animal. Conclusões. A alta prevalência de resistência aos antimicrobianos na avicultura no Equador exige o desenvolvimento de diretrizes e regulamentos sobre o uso de antimicrobianos e o envolvimento com os produtores de gado e avícolas. O sistema de vigilância existente precisa ser reforçado para melhorar o monitoramento do uso de antimicrobianos e a evolução dos padrões de resistência.

Espécies de Candida causadoras de vulvovaginites e resistência aos antifúngicos utilizados no tratamento / Candida species cause vulvovaginitis and resistance to antifungals used for treatment

Neste estudo foram identificadas espécies de Candida em isolados de secreção vaginal, avaliados os perfis de suscetibilidade in vitro a antifúngicos e correlacionados com os antifúngicos prescritos para pacientes em um serviço de atenção primária. A identificação das espécies pela Reação em Cadeia da Polimerase mostrou que 36,5% dos isolados foram caracterizados como espécie não-C.albicans. Nos testes de sensibilidade a maioria dos isolados foi suscetível a cetoconazol, fluconazol e itraconazol, contudo cerca de 40% e 50% apresentaram resistência ou sensibilidade dose-dependente a miconazol e nistatina, respectivamente. A análise dos fármacos prescritos para as pacientes revelou que 34,2% dos isolados foram considerados resistentes aos agentes utilizados no tratamento. Diversas espécies de Candida podem causar vulvovaginite com variados perfis de suscetibilidade aos antifúngicos comumente utilizados no tratamento. A identificação das espécies de Candida é relevante para o gerenciamento epidemiológico das infecções, além de ser útil, assim como os testes de suscetibilidade, na escolha do tratamento farmacológico mais eficaz para a paciente.

In this study were identified Candida species from vaginal secretion isolates, evaluated their in vitro antifungal susceptibilities, and correlated these features with antifungal agents prescribed for patients assisted in a primary care service. Species identification by Polymerase Chain Reaction showed that 36.5% of isolates were characterized as non-C. albicans species. In antifungal susceptibility tests most isolates were susceptible to ketoconazole, fluconazole, and itraconazole, although between 40% and 50% of isolates show resistance or dose-dependent susceptibility to miconazole and nystatin, respectively. Analysis of drugs prescribed to patients revealed that 34.2% of the isolates were considered resistant to agents used in treatment. Several Candida species can cause vulvovaginitis and exhibit different susceptibility profiles to antifungal drugs used in treatment. The identification of Candida species is relevant and useful to the epidemiological management of infections. The antifungal susceptibility test may also be useful for choosing most effective drug treatment for each patient.

Evaluation of susceptibility and response in the surface of agents of surface mycoses (Trichophyton mentagrophytes; T. tonsurans) to antifungal drugs of interest in a medical clinic / Avaliação da susceptibilidade e resposta in vitro de agentes de micoses superficiais (Trichophyton mentagrophytes; T. tonsurans) à drogas antifúngicas de interesse em clínica médica

INTRODUCTION: The resistance of fungal species to drugs usually used in clinics is of great interest in the medical field. OBJECTIVE: To evaluate susceptibility and in vitro response of species of Trichophyton spp. to antifungal drugs of interest in clinical medicine. METHODS: 12 samples of clinical isolates from humans were used, nine of T. mentagrophytes and three of T. tonsurans. Susceptibility tests were performed according to the agar diffusion (AD) and broth microdilution (BM) methods. RESULTS: In the AD method, the species T. tonsurans presented a percentage of sensitivity of 33% in relation to amphotericin B and 66% to itraconazole, with 100% resistance to ketoconazole and fluconazole. T. mentagrophytes also showed 100% resistance to ketoconazole in this technique, with 11% sensitivity to ketoconazole, 22% to itraconazole and 22% of samples classified as sensitive dose dependent. In the MC method, the species T. tonsurans presented a sensitivity percentage of 66%, 55% and 33% in relation to ketoconazole, fluconazole and itraconazole, respectively. The T. mentagrophytes species presented sensitivity percentages of 11%, 11%, 33% and 55% for amphotericin B, itraconazole, ketoconazole and fluconazole, respectively. CONCLUSION: There was resistance in vitro of the species of T. mentagrophytes and T. tonsurans against the antifungal fluconazole and relative resistance against ketoconazole in the AD method. In BM, however, important percentages of sensitivity were observed for the two species analyzed in relation to the antifungals fluconazole and ketoconazole when compared to itraconazole and amphotericin B.

INTRODUÇÃO: A resistência de espécies fúngicas às drogas usualmente empregadas no meio clínico é motivo de grande interesse na área médica. OBJETIVO: Avaliar susceptibilidade e resposta in vitro de espécies de Trichophyton spp. a drogas antifúngicas de interesse em clínica médica. MÉTODOS: Foram utilizadas 12 amostras de isolados clínicos de humanos, sendo nove de T. mentagrophytes e três de T. tonsurans. Foram realizados testes de susceptibilidade segundo os métodos de difusão em ágar (DA) e microdiluição em caldo (MC). RESULTADOS: No método de DA, a espécie T. tonsurans apresentou percentual de sensibilidade de 33% em relação à anfotericina B e de 66% ao itraconazol, com 100% de resistência frente ao cetoconazol e ao fluconazol. A espécie T. mentagrophytes também apresentou 100% de resistência frente ao cetoconazol nesta técnica, com 11% de sensibilidade ao cetoconazol, 22% ao itraconazol e 22% das amostras classificadas como sensível dose dependente. No método de MC, a espécie T. tonsurans apresentou percentual de sensibilidade de 66%, 55% e 33% em relação ao cetoconazol, fluconazol e itraconazol, respectivamente. A espécie T. mentagrophytes apresentou percentuais de sensibilidade de 11%, 11%, 33% e 55% para anfotericina B, itraconazol, cetoconazol e fluconazol, respectivamente. CONCLUSÃO: Houve resistência in vitro das espécies do T. mentagrophytes e T. tonsurans frente ao antifúngico fluconazol e resistência relativa frente ao cetoconazol no método de DA. Na MC, no entanto, foram observados importantes percentuais de sensibilidade das duas espécies analisadas frente aos antifúngicos fluconazol e cetoconazol quando comparadas ao itraconazol e à anfotericina B.

Study of the scientific production of the antibacterial activity of the chemical compounds of the essential oil of Lippia sidoides / Estudo da produção científica da atividade antibacteriana dos componentes químicos do óleo essencial de Lippia sidoides

Lippia sidoides Cham. has widespread use in folk medicine because its essential oil (EO) presents great antibacterial properties. In Brazil, this plant has been introduced in governmental programs for herbal medicine, due to its recognized therapeutic activities. This promoted greater interest in the search for new molecules with antimicrobial activity in this EO which have been described by several authors. Thus, this work aimed to present a study of the scientific production of antibacterial activity of the chemical compounds from L. sidoides essential oil (LSEO). The inclusion criteria were articles which assessed the chemical components and antibacterial activity through the inhibition diameter, Minimum Inhibitory Concentration (MIC), and Minimal Bactericidal Concentration (MBC), published between 2000 and 2020. Of the 996 studies identified, 55 met the inclusion criteria. In descending order, the most frequently detected chemical components found in LSEO were: thymol, p-cymene, and caryophillene. Regarding to the origin, the results showed that the extraction of EO were carried out mainly in the Northeast (55.5%) and Southeast (19%) regions of Brazil; and the part of the plant most used for the production were the leaves. In addition, the essential oil showed strong antibacterial activity against most of the bacteria tested.(AU)

Lippia sidoides Cham. é amplamente utilizada na medicina popular devido às propriedades antibacterianas atribuídas ao seu óleo essencial (OE). No Brasil, esta planta tem sido introduzida em programas governamentais de fitoterapia, por causa de suas atividades terapêuticas. Isso promoveu um maior interesse na busca por novas moléculas com atividade antimicrobiana presentes neste óleo, as quais foram relatadas por diversos autores. Assim, este trabalho objetivou apresentar um estudo da produção científica da atividade antibacteriana dos compostos químicos do OE da L. sidoide. Para tanto, foram utilizados artigos que abordaram os componentes químicos e atividade antibacteriana por meio de dados de diâmetro de inibição, Concentração Inibitória Mínima (CIM) e Concentração Bactericida Mínima (CBM), publicados entre 2000 e 2020. De um total de 996 estudos identificados, 55 preencheram os critérios de inclusão. Em ordem decrescente, os componentes químicos mais comumente encontrados no OE da L. sidoide foram: timol, p-cimeno e cariofileno. Com relação à origem, os resultados mostraram que a extração do OE foi realizada principalmente nas regiões Nordeste (55,5%) e Sudeste (19%) do Brasil; e a parte da planta mais utilizada para a produção foram as folhas. Além disso, o OE apresentou uma forte atividade antibacteriana contra a maioria das bactérias testadas. (AU)

Perfil microbiológico e de resistência aos antimicrobianos dos pacientes internados na Unidade de Queimaduras do Hospital Geral "José Pangella" de Vila Penteado / Microbiological profile and antimicrobial resistance profile of patients admitted to the Burn Unit of Hospital Geral "José Pangella" in Vila Penteado, Brazil

Introdução: As queimaduras são responsáveis por cerca de 180.000 mortes por ano no mundo e cerca de 1.000.000 de acidentes, mais de 100.000 internações hospitalares e 2.500 mortes por ano no Brasil. Dentre as causas de morbidade e mortalidade do paciente queimado, destacam-se as infecções. O conhecimento do perfil microbiológico e o adequado tratamento dos casos de infecção impactam na diminuição nas taxas de morbimortalidade. O objetivo é analisar o perfil microbiológico e de resistência aos antimicrobianos dos pacientes internados na Unidade de Queimaduras do Hospital Geral "José Pangella" de Vila Penteado, durante o período de 2011 a 2018. Métodos: O estudo é retrospectivo e levantou todos os exames microbiológicos dos pacientes internados por queimaduras na Unidade de Queimaduras do Hospital Geral "José Pangella" de Vila Penteado, localizado na cidade de São Paulo, durante o período de janeiro de 2011 até o final de dezembro de 2018. Resultados: Foram isolados 495 microrganismos, sendo 436 bactérias (88,080%) e 59 fungos (11,919%). Entre as amostras analisadas, a maior prevalência foi do Staphylococcus sp., seguido por Pseudomonas sp. e Klebsiella sp., destacando-se, ainda, Candida sp. e Acinetobacter sp. Conclusão: O manuseio dos pacientes vítimas de queimaduras continua sendo um grande desafio para os centros de tratamento de queimaduras. Identificar os patógenos responsáveis pelas infecções dos pacientes pode acarretar em uma otimização do tratamento, com a escolha de um antibiótico eficaz, e, dessa forma, acarretar na redução da morbimortalidade desses pacientes, além de diminuir tempo de internação e custos utilizados de maneira significativa.

Introduction: Burns are responsible for about 180,000 deaths per year worldwide and about 1,000,000 accidents, more than 100,000 hospital admissions and 2,500 deaths per year in Brazil. Among the causes of morbidity and mortality of burn patients, infections stand out. Knowledge of the microbiological profile and appropriate treatment of infection cases impact on the decrease in morbidity and mortality rates. The Objetive is to analyze the microbiological profile and antimicrobial resistance profile of patients admitted to the Burn Unit of the General Hospital "José Pangella" of Vila Penteado from 2011 to 2018. Methods: This is a retrospective study and surveyed all microbiological examinations of patients hospitalized for burns at the "José Pangella" Burns Unit of Vila Penteado General Hospital, located in the city of São Paulo, from January 2011 until the end of December 2018. Results: 495 microorganisms were isolated, being 436 bacteria (88,080%) and 59 fungi (11,919%). Among the samples analyzed, the highest prevalence was Staphylococcus sp., followed by Pseudomonas sp., Klebsiella sp., Candida sp. and Acinetobacter sp. Conclusion: Handling burn patients remains a major challenge for burn treatment centers. Identifying the pathogens responsible for patients infections may result in optimal treatment, with an effective antibiotic choice and reducing the morbidity and mortality of these patients, as well as significantly reducing hospitalization time and costs.

Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga / Antimicrobial Resistance Profiles of Bacterial Isolates in Patients with Urinary Tract Infections in a Reference Center in Bucaramanga / Perfil de resistência antimicrobiana de isulados bacterianos em pacientes com infecção urinária de um centro de referência em Bucaramanga

Introducción. Dentro de las infecciones bacterianas que afectan al ser humano, la infección de las vías urinarias es una de las más frecuentes, afectando hasta 150 millones de personas en el mundo cada año. El uso indiscriminado de antibióticos y su manejo inadecuado han generado un aumento en la resistencia antimicrobiana. El objetivo del presente estudio es describir patrones fenotípicos de resistencia antimicrobiana de los microorganismos más frecuentes en pacientes con diagnóstico de infección de vías urinarias en centro de referencia de Bucaramanga. Metodología. Estudio de corte transversal, muestreo no probabilístico en pacientes con sospecha o diagnóstico de infecciones de vías urinarias que requirieron manejo intrahospitalario en una institución de salud de alta complejidad durante julio del 2017 y abril del 2018, de quienes se obtuvo urocultivo y antibiograma. Resultados. De 120 pacientes incluidos, se obtuvo un reporte de 116 urocultivos. El microorganismo más frecuente fue Escherichia coli, seguido de Klebsiella pneumoniae. El primero presentó alta sensibilidad a carbapenémicos y aminoglucósidos, baja sensibilidad a la Ceftriaxona y a la Ampicilina/Sulbactam. Por otro lado, el microorganismo Klebsiella pneumoniae presentó alta sensibilidad a carbapenémicos, pero resistencia elevada a la Ampicilina/Sulbactam y a la Ceftriaxona. El antibiótico empírico más utilizado fue la Ceftriaxona. Discusión. La distribución de microorganismos aislados es comparable con la ya descrita a nivel nacional e internacional. Los perfiles de resistencia antimicrobiana tienen puntos comunes como la resistencia a los betalactámicos, pero difieren en algunos aspectos, como la resistencia a cefalosporinas y quinolonas. Conclusiones. Los microorganismos aislados presentan altas tasas de resistencia a los betalactámicos y a las cefalosporinas, las cuales son ampliamente utilizadas. Esta información debe orientar el desarrollo de protocolos que permitan optimizar la toma de decisiones clínicas con respecto a la terapia antibiótica. Cómo citar. Delgado-Serrano J, Albarracín MJ, Rangel-Vera JA, Galeano-Salazar E, Niño-Vargas D, Wilches-Cuadros MA, Et al. Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga. MedUNAB. 2020;23(3):405-413. Doi: doi.org/10.29375/01237047.3950

Introduction. Among the bacterial infections that affect human beings, urinary tract infections are one of the most common, affecting up to 150 million people worldwide each year. Indiscriminate use of antibiotics and their improper handling has generated an increase in microbial resistance. This study's objective is to describe the phenotypic patterns of antimicrobial resistance of the most frequent microorganisms in patients with urinary tract infection diagnoses in a reference center in Bucaramanga. Methodology. A cross-sectional study with non probability sampling on patients with suspected or diagnosed urinary tract infections who required hospital treatment at a high-complexity health institution during July, 2017 and April, 2018, from whom urine cultures and antibiograms were obtained. Results. Out of 120 patients, a report was obtained for 116 urine cultures. The most frequent microorganism was Escherichia coli, followed by Klebsiella pneumoniae. The former presented high sensitivity to carbapenem antibiotics and aminoglycosides and low sensitivity to Ceftriaxone and Ampicillin/Sulbactam. On the other hand, the microorganism Klebsiella pneumoniae presented high sensitivity to carbapenem antibiotics, but elevated resistance to Ceftriaxone and Ampicillin/Sulbactam. The empiric antibiotic used most was Ceftriaxone. Discussion. The distribution of isolated microorganisms is comparable to that which has been described nationally and internationally. Antimicrobial resistance profiles have points in common, such as resistance to beta-lactams, but differ in some aspects, such as resistance to cephalosporins and quinolones. Conclusions. Isolated microorganisms present high rates of resistance to beta-lactams and cephalosporins, which are widely used. This information must guide developing protocols that allow optimizing clinical decision-making with respect to antibiotic therapy. Cómo citar. Delgado-Serrano J, Albarracín MJ, Rangel-Vera JA, Galeano-Salazar E, Niño-Vargas D, Wilches-Cuadros MA, Et al. Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga. MedUNAB. 2020;23(3):414-422. Doi: doi.org/10.29375/01237047.3950

Introdução. Dentre as infecções bacterianas que afetam o homem, a infecção do trato urinário é uma das mais frequentes, afetando até 150 milhões de pessoas no mundo a cada ano. O uso indiscriminado de antibióticos e seu manejo inadequado têm gerado aumento da resistência antimicrobiana. O objetivo deste estudo é descrever padrões fenotípicos de resistência antimicrobiana dos microrganismos mais frequentes em pacientes com diagnóstico de infecção do trato urinário em um centro de referência em Bucaramanga. Métodos. Estudo transversal, com amostra não probabilística, em pacientes com suspeita ou diagnóstico de ITU que precisaram de manejo intra-hospitalar em uma instituição de saúde de alta complexidade no período de julho de 2017 a abril de 2018. Foram obtidos urocultura e antibiograma desses pacientes. Resultados. De 120 pacientes incluídos, foi obtido um relatório de 116 uroculturas. O microrganismo mais frequente foi Escherichia coli, seguido por Klebsiella pneumoniae. O primeiro apresentou alta sensibilidade a carbapenêmicos e aminoglicosídeos e baixa sensibilidade a Ceftriaxona e a Ampicilina/Sulbactam. Por outro lado, o microrganismo Klebsiella pneumoniae apresentou alta sensibilidade a carbapenêmicos, mas alta resistência a Ampicilina/Sulbactam e a Ceftriaxona. O antibiótico empírico mais amplamente utilizado foi a Ceftriaxona. Discussão. A distribuição dos microrganismos isolados é comparável àquela já descrita a nível nacional e internacional. Os perfis de resistência antimicrobiana têm pontos comuns como resistência aos beta-lactâmicos, mas diferem em alguns aspectos, como resistência às cefalosporinas e quinolonas. Conclusão. Microrganismos isolados apresentam altas taxas de resistência aos beta-lactâmicos e cefalosporinas, que são amplamente utilizados. Esta informação deve nortear o desenvolvimento de protocolos que permitam otimizar a tomada de decisão clínica em relação à antibioticoterapia. Cómo citar. Delgado-Serrano J, Albarracín MJ, Rangel-Vera JA, Galeano-Salazar E, Niño-Vargas D, Wilches-Cuadros MA, Et al. Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga. MedUNAB. 2020;23(3):405-413. Doi: doi.org/10.29375/01237047.3950

Antimicrobial Resistance Profiles of Bacterial Isolates in Patients with Urinary Tract Infections in a Reference Center in Bucaramanga / Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga / Perfil de resistência antimicrobiana de isulados bacterianos em pacientes com infecção urinária de um centro de referência em Bucaramanga

Introduction. Among the bacterial infections that affect human beings, urinary tract infections are one of the most common, affecting up to 150 million people worldwide each year. Indiscriminate use of antibiotics and their improper handling has generated an increase in microbial resistance. This study's objective is to describe the phenotypic patterns of antimicrobial resistance of the most frequent microorganisms in patients with urinary tract infection diagnoses in a reference center in Bucaramanga. Methodology. A cross-sectional study with non probability sampling on patients with suspected or diagnosed urinary tract infections who required hospital treatment at a high-complexity health institution during July, 2017 and April, 2018, from whom urine cultures and antibiograms were obtained. Results. Out of 120 patients, a report was obtained for 116 urine cultures. The most frequent microorganism was Escherichia coli, followed by Klebsiella pneumoniae. The former presented high sensitivity to carbapenem antibiotics and aminoglycosides and low sensitivity to Ceftriaxone and Ampicillin/Sulbactam. On the other hand, the microorganism Klebsiella pneumoniae presented high sensitivity to carbapenem antibiotics, but elevated resistance to Ceftriaxone and Ampicillin/Sulbactam. The empiric antibiotic used most was Ceftriaxone. Discussion. The distribution of isolated microorganisms is comparable to that which has been described nationally and internationally. Antimicrobial resistance profiles have points in common, such as resistance to beta-lactams, but differ in some aspects, such as resistance to cephalosporins and quinolones. Conclusions. Isolated microorganisms present high rates of resistance to beta-lactams and cephalosporins, which are widely used. This information must guide developing protocols that allow optimizing clinical decision-making with respect to antibiotic therapy. Cómo citar. Delgado-Serrano J, Albarracín MJ, Rangel-Vera JA, Galeano-Salazar E, Niño-Vargas D, Wilches-Cuadros MA, Et al. Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga. MedUNAB. 2020;23(3):414-422. Doi: doi.org/10.29375/01237047.3950

Introducción. Dentro de las infecciones bacterianas que afectan al ser humano, la infección de las vías urinarias es una de las más frecuentes, afectando hasta 150 millones de personas en el mundo cada año. El uso indiscriminado de antibióticos y su manejo inadecuado han generado un aumento en la resistencia antimicrobiana. El objetivo del presente estudio es describir patrones fenotípicos de resistencia antimicrobiana de los microorganismos más frecuentes en pacientes con diagnóstico de infección de vías urinarias en centro de referencia de Bucaramanga. Metodología. Estudio de corte transversal, muestreo no probabilístico en pacientes con sospecha o diagnóstico de infecciones de vías urinarias que requirieron manejo intrahospitalario en una institución de salud de alta complejidad durante julio del 2017 y abril del 2018, de quienes se obtuvo urocultivo y antibiograma. Resultados. De 120 pacientes incluidos, se obtuvo un reporte de 116 urocultivos. El microorganismo más frecuente fue Escherichia coli, seguido de Klebsiella pneumoniae. El primero presentó alta sensibilidad a carbapenémicos y aminoglucósidos, baja sensibilidad a la Ceftriaxona y a la Ampicilina/Sulbactam. Por otro lado, el microorganismo Klebsiella pneumoniae presentó alta sensibilidad a carbapenémicos, pero resistencia elevada a la Ampicilina/Sulbactam y a la Ceftriaxona. El antibiótico empírico más utilizado fue la Ceftriaxona. Discusión. La distribución de microorganismos aislados es comparable con la ya descrita a nivel nacional e internacional. Los perfiles de resistencia antimicrobiana tienen puntos comunes como la resistencia a los betalactámicos, pero difieren en algunos aspectos, como la resistencia a cefalosporinas y quinolonas. Conclusiones. Los microorganismos aislados presentan altas tasas de resistencia a los betalactámicos y a las cefalosporinas, las cuales son ampliamente utilizadas. Esta información debe orientar el desarrollo de protocolos que permitan optimizar la toma de decisiones clínicas con respecto a la terapia antibiótica. Cómo citar. Delgado-Serrano J, Albarracín MJ, Rangel-Vera JA, Galeano-Salazar E, Niño-Vargas D, Wilches-Cuadros MA, Et al. Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga. MedUNAB. 2020;23(3):405-413. Doi: doi.org/10.29375/01237047.3950

Introdução. Dentre as infecções bacterianas que afetam o homem, a infecção do trato urinário é uma das mais frequentes, afetando até 150 milhões de pessoas no mundo a cada ano. O uso indiscriminado de antibióticos e seu manejo inadequado têm gerado aumento da resistência antimicrobiana. O objetivo deste estudo é descrever padrões fenotípicos de resistência antimicrobiana dos microrganismos mais frequentes em pacientes com diagnóstico de infecção do trato urinário em um centro de referência em Bucaramanga. Métodos. Estudo transversal, com amostra não probabilística, em pacientes com suspeita ou diagnóstico de ITU que precisaram de manejo intra-hospitalar em uma instituição de saúde de alta complexidade no período de julho de 2017 a abril de 2018. Foram obtidos urocultura e antibiograma desses pacientes. Resultados. De 120 pacientes incluídos, foi obtido um relatório de 116 uroculturas. O microrganismo mais frequente foi Escherichia coli, seguido por Klebsiella pneumoniae. O primeiro apresentou alta sensibilidade a carbapenêmicos e aminoglicosídeos e baixa sensibilidade a Ceftriaxona e a Ampicilina/Sulbactam. Por outro lado, o microrganismo Klebsiella pneumoniae apresentou alta sensibilidade a carbapenêmicos, mas alta resistência a Ampicilina/Sulbactam e a Ceftriaxona. O antibiótico empírico mais amplamente utilizado foi a Ceftriaxona. Discussão. A distribuição dos microrganismos isolados é comparável àquela já descrita a nível nacional e internacional. Os perfis de resistência antimicrobiana têm pontos comuns como resistência aos beta-lactâmicos, mas diferem em alguns aspectos, como resistência às cefalosporinas e quinolonas. Conclusão. Microrganismos isolados apresentam altas taxas de resistência aos beta-lactâmicos e cefalosporinas, que são amplamente utilizados. Esta informação deve nortear o desenvolvimento de protocolos que permitam otimizar a tomada de decisão clínica em relação à antibioticoterapia. Cómo citar. Delgado-Serrano J, Albarracín MJ, Rangel-Vera JA, Galeano-Salazar E, Niño-Vargas D, Wilches-Cuadros MA, Et al. Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga. MedUNAB. 2020;23(3):405-413. Doi: doi.org/10.29375/01237047.3950

Influence of ibuprofen-arginine on the concentration of amoxicillin in the plasma and tissues of rats with induced periapical lesion / Influência do ibuprofeno arginina sobre a concentração plasmática e tecidual da amoxicilina em ratos com lesão periapical induzida

ABSTRACT Objective The aim of this study was to evaluate the influence of ibuprofen-arginine on the concentration of amoxycillin in the plasma and periapical tissues of rats with induced apical periodontitis. Methods Twenty-eight Wistar rats were divided into the following four groups: PL: placebo (saline); AM: amoxycillin (100 mg/kg); IB: ibuprofen-arginine (100 mg/kg); and AM+IB: amoxycillin (100 mg/kg) + ibuprofen-arginine (100 mg/kg). The animals were submitted to pulp exposure in the first lower left molar, which remained open for fifteen days; this was then closed with composite resin and remained for a further seven days. The treatments were performed using a single dose of the medication (gavage) one hour before taking the samples. Two mL of blood was collected from the aorta to obtain the blood plasma and the periapical tissue samples, which were homogenized to obtain the supernatant. The samples (plasma and the supernatant periapical tissue) were used to obtain the antibiogram for the analysis of the levels of amoxycillin in the plasma and periapical tissues. Results The amoxycillin concentration was higher in the AM group compared to the other groups (p < 0.05, ANOVA with Tukey's test). Ibuprofen-arginine interfered with plasma concentration of amoxycillin; however, the AM+IB group had a higher concentration of amoxycillin than the PL and IB groups (p < 0.05, ANOVA with Tukey's test). The analysis of the supernatant from the periapical tissues showed no significant difference between the groups (p > 0.05, Kruskal-Wallis test). Conclusion Ibuprofenarginine can interfere with the plasma concentration of amoxycillin but this study failed to show the effect of ibuprofen-arginine on the concentration of amoxycillin in the periapical tissues .

RESUMO Objetivo A proposta desta pesquisa foi avaliar a influência do ibuprofeno arginina, sobre a concentração de amoxicilina no plasma e no tecido periapical de ratos com periodontite apical induzida. Métodos Foram utilizados 28 ratos Wistar, divididos em 4 grupos:PL: placebo (salina); AM: amoxicilina (100mg/kg); IB: ibuprofeno arginina (100mg/kg); e AM+IB: amoxicilina (100mg/kg) + ibuprofeno arginina (100mg/kg). Os animais foram submetidos à exposição pulpar do primeiro molar inferior esquerdo que permaneceu aberto por 15 dias e, então, fechado com resina composta, permanecendo por mais 07 dias. Os tratamentos foram realizados com dose única dos medicamentos (gavagem), uma hora antes da obtenção das amostras. Foram coletados 2mL de sangue da artéria aorta para a obtenção do plasma sanguíneo e amostras do tecido periapical que foram homogeneizadas para a obtenção do sobrenadante. A partir das amostras (plasma e sobrenadante do tecido periapical) realizou-se o antibiograma para análise da concentração plasmática e tecidual de amoxicilina. Resultados A concentração de antibiótico foi maior no grupo AM em comparação aos demais grupos (p<0,05, ANOVA com Tukey). O ibuprofeno arginina interferiu na concentração plasmática de amoxicilina, no entanto, a concentração de amoxicilina no grupo AM+IB foi maior que nos grupos PL e IB (p<0,05, ANOVA com Tukey). A análise do sobrenadante do tecido periapical não mostrou diferença significativa entre os grupos (p>0,05, Kruskal-Wallis). Conclusão O ibuprofeno arginina podeinterferir com a concentração plasmática de amoxicilina, porém o estudo não foi capaz de mostrar o efeito do anti-inflamatório na concentração de amoxicilina no tecido periapical.

Antimicrobial Action of Hydroalcoholic Extract from Cymbopogonous citrus Staupf (capimlimão), Rosmarinus officinalis L (alecrim) and Lychnophora ericoides (arnica) / Ação Antimicrobiana de Extrato Hidroalcóolico de Folhas de Cymbopagon citratus Staupf (capim-limão), Rosmarinus officinalis L (alecrim) e Lychnophora ericoides (arnica)

Infectious diseases are always a concern, since the effectiveness of several antimicrobials in certain situations has decreased due to the microbial resistance developed over the years. Research in the area of antimicrobial drug development has been intensified in recent decades. The objective of this work was to verify in vitro the antimicrobial activity of hydroalcoholic extracts of lemongrass, rosemary and arnica. Bacteria used in the test were S. aureus, K. pneumoniae and E.coli. The extracts were obtained from the plants dry leaves in maceration with 70% cereal alcohol for seven days. The total soluble solids concentration of each extract was obtained by gravimetry. The extracts antimicrobial activity was obtained by the pour-plate technique, in which the colonies were counted. Under the conditions in which the tests were performed in the stage of microbial growth was observed with lemongrass and rosemary extracts, and the stage rate was zero. However, S. aureus was sensitive to the arnica hydroalcoholic extract in the concentration of 4.00 mg / mL with inhibition rate of 100%, reducing as the extract concentration was lower. At different concentrations, the arnica hydroalcoholic extract had a low inhibitory capacity for K. pneumoniae and E. coli. The plants antimicrobial activity varies greatly in relation to the botanical characteristics (cultivation, soil, harvest) and the extraction method (solvents of different polarities and techniques), for that reason, there are many varied results in several studies. Therefore, many studies are needed to confirm the antimicrobial efficacy of plant strata. (AU)

As doenças infecciosas são sempre preocupantes, pois a eficácia de vários antimicrobianos em certas situações, diminuiu em função da resistência microbiana, desenvolvida ao longo dos anos. As pesquisas na área de desenvolvimento de fármacos antimicrobianos, intensificaramse muito nas últimas décadas. O objetivo desse trabalho foi verificar in vitro a atividade antimicrobiana de extratos hidroalcoólicos de capimlimão, alecrim e arnica. As bactérias utilizadas no teste foram S. aureus, K. pneumoniae e E.coli. Os extratos foram obtidos das folhas secas das plantas, em maceração com álcool cereal a 70%, durante sete dias. A concentração de sólidos solúveis totais de cada extrato foi obtida por gravimetria. A atividade antimicrobiana dos extratos foi obtida pela técnica pour-plate, em que se procedeu a contagem de colônias. Nas condições em que os testes foram realizados não foram observados inibição do crescimento microbiano com os extratos de capim-limão e alecrim, sendo a taxa de inibição zero. Entretanto, o S. aureus mostrou-se sensível ao extrato hidroalcóolico de arnica na concentração de 4,00mg/mL com taxa de inibição de 100%, reduzindo conforme a concentração do extrato era menor. Nas diferentes concentrações, o extrato hidroalcoolico de arnica, apresentou uma baixa capacidade inibitória para a K. pneumoniae e E.coli. A atividade antimicrobiana das plantas varia muito em relação as características botânicas (cultivo, solo, colheita) e ao método de extração (solventes de polaridades diferentes e técnicas), por essa razão, há resultados bem variados nas diversas pesquisas. Assim sendo, muitos estudos são necessários para confirmar a eficácia antimicrobiana dos extratos vegetais. (AU)

Custo-efetividade de teste rápido de detecção de Klebsiella spp. para rastreio hospitalar / Cost effectiveness of rapid testing for detection of Klebsiella spp. for hospital screening

Introdução: A resistência bacteriana é um problema mundial, atingindo principalmente países em desenvolvimento. Estima-se que no futuro vai matar mais que o câncer e custar 100 trilhões de dólares até 2050. Objetivo: O presente trabalho teve por objetivo identificar a razão de custo-efetividade incremental (RCEI) do rastreio de infecção por Klebsiella pneumoniae produtora de carbapenemase (KPC) conforme protocolo vigente para produção de carbamapenase em comparação com a utilização de protocolo de triagem utilizando teste rápido (PCR em tempo real). Métodos: Foi realizado estudo do tipo análise de custo-efetividade, utilizando um modelo de árvore de decisão e foram utilizados no estudo dados secundários de fontes governamentais e da literatura científica, considerando-se a perspectiva do sistema de saúde público. A população foi composta por adultos internados em hospitais em risco de infecção por KPC. Resultados: O presente trabalho identificou que o uso de testes de identificação de KPC com técnicas em tempo real é dominante em relação ao teste convencional, com razão de custo-efetividade incremental de R$ -426,53/0,3, ou seja, 1.421,76 reais por caso corretamente identificado favorável a teste molecular. Conclusões: O uso de testes rápidos para detecção de KPC pode ser considerado como um método de rastreio eficiente.

Introduction: Bacterial resistance is a worldwide problem, affecting mainly developing countries. It is estimated that in the future will kill more than cancer and cost US$ 100 trillion by 2050. Objective: The aim of this study was to identify the incremental cost-effectiveness ratio (ICER) of the screening of Klebsiella pneumoniae that produces carbapenemase (KPC) infection according to the current protocol for carbamapenase production compared to the use of screening protocol using rapid test (real-time PCR). Methods: A cost-effectiveness analysis was performed using a decision tree model. Secondary data from governmental sources and the scientific literature will be used in the study, considering the perspective of the public health system. The population was composed of adult hospitalized patients at risk of KPC infection. Results: The present work identified that the use of KPC identification tests with real-time techniques are dominant in relation to the conventional test, with cost ratio incremental effectiveness of R$ -426.53/0.3, that is, 1,421.76 reais per case correctly identified favorable to the molecular test. Conclusions: The use of rapid tests for detection of KPC Can be regarded as an efficient screening method.

Método fenotípico automatizado versus método manual na identificação de microorganismos isolados de hemoculturas: desfechos clínicos e microbiológicos / Automated phenotypic method versus manual method in the identification of microorganisms isolated from blood cultures: clinical and microbiological outcomes

INTRODUÇÃO: A automação laboratorial é cada vez mais utilizada em microbiologia, no entanto, poucos estudos avaliam desfechos clínicos em comparação aos métodos tradicionais. No Brasil, nenhum estudo com esse objetivo foi detectado. OBJETIVO: Analisar os impactos clínicos e microbiológicos após implantação de método fenotípico automatizado em um serviço de microbiologia. MÉTODOS: Realizamos estudo observacional e retrospectivo no laboratório de microbiologia referente a exame de hemocultura de pacientes da Unidade de Terapia Intensiva (UTI). Os dados foram coletados de pacientes internados entre janeiro/2014 a dezembro/2015. Analisou-se o tempo de internação, número de terapias empíricas, óbitos e dados relacionados ao isolamento microbiológico. A amostra foi obtida por conveniência. Para a comparação entre os desfechos foram empregados os testes t de Student e Qui-quadrado de Pearson. O programa empregado foi o Stata release, versão 11, sendo considerados significativos valores de p<0,05. RESULTADOS: Foram avaliados 472 pacientes. Não houve redução na prescrição empírica de antimicrobianos (54,7% vs 45,3%; p=0,33), tempo de internação na UTI (14,5 dias vs 15,8 dias p=0,78) e na taxa de óbitos (54,4% vs 45,6%; p=0,36). Similarmente, o perfil de agentes isolados em ambos os métodos não parece ser discrepante, no entanto, houve um aumento de 44,7% no número de isolados microbianos (76 vs 110) com melhor caracterização dos mesmos. CONCLUSÃO: A automação do laboratório de microbiologia não impactou no tempo de internação, mortalidade na UTI e no número de terapias empíricas. No entanto, a identificação e o isolamento de microrganismos melhoraram.

INTRODUCTION: Automation is increasingly used in microbiology laboratory, however, few studies assessed clinical outcomes compared to traditional methods. In Brazil, no studies with this objective were detected. OBJECTIVE: To analyze the clinical and microbiological impacts after implantation of an automated phenotypic method in a microbiology service. METHODS: Observational and retrospective study carried out on the microbiology laboratory involving blood culture test from intensive care unit (ICU) patients. Data were collected from hospitalized patients between January 2014 and December 2015. The length of hospitalization, number of empirical therapies, deaths and information related to microbiological isolation were analyzed. The sample was obtained by convenience. Pearson's Chisquare and Student's t-tests were used to compare outcomes. The program used was the Stata release, version 11, being considered significant values of p<0.05. RESULTS: A total of 472 patients were evaluated. There was no reduction in the empirical prescription of antimicrobials (54.7% vs 45.3%; p=0.33), ICU stay (14.5 days vs 15.8 days; p=0.78) and mortality (54.4% vs 45.6%; p=0.36). Similarly, profile of isolated agents in both methods did not appear to be discrepant, however, there was an increase of 44.7% in the number of microbial isolates (76 vs 110) and a better characterization of them. CONCLUSION: The microbiology laboratory automation did not modify the length of stay, ICU mortality and the number of empirical therapies. However, identification and isolation of microorganisms was improved.

Blefarite: epidemiologia, etiologia, apresentações clínicas, tratamento e evolução de nossos pacientes / Blepharitis: epidemiology, etiology, clinical presentations, treatment and evolution of our patients

Resumo Objetivo: A blefarite é uma das condições mais comumente encontradas na prática oftalmológica e se constitui em uma causa frequente de irritação e desconforto ocular. Por ser uma doença de difícil tratamento, os autores buscaram compreender melhor a epidemiologia, etiologia, apresentações clínicas, tratamento e evolução de seus pacientes, visando maior sucesso terapêutico. Métodos: Foram avaliados retrospectivamente e transversalmente o prontuário de 124 pacientes do Centro de Oftalmologia Tadeu Cvintal, os quais apresentavam blefarite e foram submetidos à classificação de gravidade e coleta de secreções palpebrais para cultura bacteriana e antibiograma. Resultados: A media da idade dos pacientes foi de 67,4 anos, o sexo feminino foi responsável por 70 (56,4%) casos e o masculino por 54 (43,5%). Quanto à gravidade da doença, constatou-se 71 casos de blefarite leve (56,8%), 52 (41,6%) com intensidade moderada e 2 (1,6%) casos graves. Avaliando o seguimento do tratamento da doença, foi observado que 103 (82,4%) pacientes não retornaram para avaliar o resultado do tratamento e apenas 22 (17,6%) retornaram. Em relação às culturas realizadas, 82 (66,1%) não apresentaram crescimento microbiano. Dentre as 42 (33,8%) amostras positivas, os Staphylococcus coagulase negativo foram os mais prevalentes, sobretudo os Staphylococcus epidermidis, responsável por 35 (83,3%) delas. Quanto à sensibilidade aos antibióticos, os agentes de nossa amostra demonstraram maior resistência à Penicilina, Eritromicina e Ciprofloxacino e 100% de sensibilidade à Linezolida, Vancomicina e Daptomicina. Conclusão: Conhecendo melhor as características epidemiológicas da blefarite e a sensibilidade antimicrobiana das bactérias envolvidas, é possível oferecer tratamentos mais eficazes.

Abstract Objective: Blepharitis is one of the most commonly encountered conditions in ophthalmic practice and is a frequent cause of eye irritation and discomfort. Being a difficult to treat disease, the authors sought to better understand the epidemiology, etiology, clinical presentations, treatment and evolution of their patients, aiming at greater therapeutic success. Methods: The medical records of 124 patients of Centro de Oftalmologia Tadeu Cvintal who had blepharitis were retrospectively and cross-sectionally evaluated and underwent severity classification and collection of eyelid secretions for bacterial culture and antibiogram. Results: The mean age of the patients was 67.4 years, females accounted for 70 (56.4%) cases and males for 54 (43.5%). Regarding the severity of the disease, there were 71 cases of mild blepharitis (56.8%), 52 (41.6%) with moderate intensity and 2 (1.6%) severe cases. Evaluating the follow-up of treatment of the disease, it was observed that 103 (82.4%) patients did not return to evaluate the treatment outcome and only 22 (17.6%) returned. In respect of the cultures performed, 82 (66.1%) did not show microbial growth. Among the 42 (33.8%) positive samples, coagulase-negative staphylococci were the most prevalent, especially Staphylococcus epidermidis, responsible for 35 (83.3%) of them. As for antibiotic sensitivity, the agents in our sample showed greater resistance to Penicillin, Erythromycin and Ciprofloxacin and 100% sensitivity to Linezolid, Vancomycin and Daptomycin. Conclusion: By better understanding the epidemiological characteristics of blepharitis and the antimicrobial sensitivity of the bacteria involved, it is possible to offer more effective treatments.

Sepse neonatal - perfil microbiológico e sensibilidadeantimicrobiana em um hospital no Nordeste do Brasil / Neonatal sepsis - microbiological profile and antimicrobial sensitivity in a hospital in the Northeast of Brazil

Objetivo: Determinar a prevalência de microrganismos e o perfil de sensibilidade antimicrobiana em hemoculturas positivas de pacientes com infecção de corrente sanguínea na Unidade de Terapia Intensiva neonatal de um hospital no Nordeste brasileiro. Métodos: Estudo transversal, retrospectivo, com descrição quantitativa dos resultados de hemoculturas de neonatos admitidos na unidade terapia intensiva neonatal de um hospital do Nordeste brasileiro. Resultados: A sepse neonatal teve como principal etiologia bactérias Gram-positivas, responsáveis por 73,1% das culturas positivas, sendo o Staphylococcus Coagulase-negativa o principal agente, enquanto que 21,5% se deram por um agente Gram-negativo. As bactérias Gram-positivas apresentaram boa sensibilidade ao linezolida e à vancomicina e a maioria das Gram-negativas foi sensível a colistina, meropenem e imipenem. Todos os isolados de Staphylococcus coagulase negativa foram sensíveis ao linezolida, à vancomicina e à tigeciclina. Conclusão: O conhecimento das características relacionadas à sensibilidade e resistência antimicrobiana é fundamental para uma melhor abordagem ao paciente com sepse neonatal, promovendo um manejo mais direcionado que possibilita uma recuperação mais rápida do recém-nascido. O conhecimento adquirido com esse estudo possibilitará um tratamento mais eficiente em cada caso, com base no quadro apresentado pelo paciente e as características do agente causador.

Objective: To determine the prevalence of microorganisms and the antimicrobial sensitivity profile in positive blood cultures of patients with bloodstream infection in the neonatal Intensive Care Unit of a hospital in the Brazilian Northeast. Methods: Cross-sectional, retrospective study with quantitative description of hemoculture results of neonates admitted to the neonatal intensive care unit of a Brazilian Northeast hospital. Results: Neonatal sepsis had as its main etiology Gram-positive bacteria responsible for 73.1% of the positive cultures, with coagulase-negative Staphylococcus being the main agent, while 21.5% were due to a Gramnegative agent. Gram-positive bacteria showed good sensitivity to linezolid and vancomycin and most Gram-negative strains were susceptible to colistin, meropenem and imipenem. All coagulase-negative Staphylococcus isolates were sensitive to linezolid, vancomycin and tigecycline. Conclusion: Knowledge of the characteristics related toantimicrobial susceptibility and resistance is fundamental for a better approach to the patient with neonatal sepsis, promoting a more targeted management that allows a faster recovery of the newborn. The knowledge gained from this study will allow a more efficient treatment in each case, based on the patient's presentation and the characteristics of the causative agent

Speeding up the diagnosis of multidrug-resistant tuberculosis in a high-burden region with the use of a commercial line probe assay / Agilizando o diagnóstico da tuberculose multirresistente em uma região endêmica com o uso de um teste comercial de sondas em linha

ABSTRACT Objective: To evaluate the rapid diagnosis of multidrug-resistant tuberculosis, by using a commercial line probe assay for rifampicin and isoniazid detection (LPA-plus), in the routine workflow of a tuberculosis reference laboratory. Methods: The LPA-plus was prospectively evaluated on 341 isolates concurrently submitted to the automated liquid drug susceptibility testing system. Results: Among 303 phenotypically valid results, none was genotypically rifampicin false-susceptible (13/13; 100% sensitivity). Two rifampicin-susceptible isolates harboured rpoB mutations (288/290; 99.3% specificity) which, however, were non-resistance-conferring mutations. LPA-plus missed three isoniazid-resistant isolates (23/26; 88.5% sensitivity) and detected all isoniazid-susceptible isolates (277/277; 100% specificity). Among the 38 (11%) invalid phenotypic results, LPA-plus identified 31 rifampicin- and isoniazid-susceptible isolates, one isoniazid-resistant and six as non-Mycobacterium tuberculosis complex. Conclusions: LPA-plus showed excellent agreement (≥91%) and accuracy (≥99%). Implementing LPA-plus in our setting can speed up the diagnosis of multidrug-resistant tuberculosis, yield a significantly higher number of valid results than phenotypic drug susceptibility testing and provide further information on the drug-resistance level.

RESUMO Objetivo: Avaliar o diagnóstico rápido de tuberculose multirresistente, utilizando um teste comercial de sondas em linha (LPA-plus), na rotina de um laboratório de referência de tuberculose. Métodos: O teste LPA-plus foi avaliado prospectivamente em 341 isolados simultaneamente submetidos ao teste de suscetibilidade aos antimicrobianos em meio líquido, pelo sistema automatizado. Resultados: Entre os 303 resultados fenotipicamente válidos, nenhum foi genotipicamente falso suscetível à rifampicina (13/13; 100% de sensibilidade). Dois isolados sensíveis à rifampicina apresentavam mutações no gene rpoB (288/290; especificidade de 99,3%), as quais, no entanto, não são associadas à resistência a rifampicina. O LPA-plus não identificou resistência à isoniazida em três isolados fenotipicamente resistentes (23/26; 88,5% de sensibilidade) e detectou todos os isolados sensíveis à isoniazida (277/277; especificidade de 100%). Entre os 38 (11%) resultados fenotípicos inválidos, o LPA-plus identificou 31 isolados sensíveis à rifampicina e à isoniazida, um resistente à isoniazida e seis como micobactérias não tuberculosas. Conclusões: O LPA-plus mostrou excelente concordância (≥91%) e acurácia (≥99%). Sua implementação pode acelerar o diagnóstico da tuberculose multirresistente, produzir número significativamente maior de resultados válidos do que o teste fenotípico de suscetibilidade aos antimicrobianos e fornecer informações adicionais sobre o nível de resistência aos fármacos.

Effective vancomycin concentrations in children: a cross-sectional study / Concentrações efetivas de vancomicina em crianças: estudo transversal

ABSTRACT Objective Analyze the microbiological effectiveness, based on the pharmacokinetics/pharmacodynamics correlation of vancomycin in pediatric patients, and to propose dose adjustment. Methods This is an observational, cross-sectional study, conducted in a pediatric hospital, over a 1-year period (2016 to 2017). Children of both sexes, aged 2 to 12 years, were included in the study; burn children, and children in renal replacement therapy were excluded. For the pharmacokinetic analysis, two samples of 2mL of whole blood were collected, respecting the 2-hour interval between each withdrawal. Results Ten pediatric patients with median age of 5.5 years and interquartile range (IQR) of 3.2-9.0 years, median weight of 21kg (IQR: 15.5-24.0kg) and median height of 112.5cm (IQR: 95-133cm), were included. Only one child achieved trough concentrations between 10µg/mL and 15µg/mL. Conclusion The empirical use of vancomycin in the children studied did not achieve the therapeutic pharmacokinetic/pharmacodynamic target for minimum inhibitory concentration of 1µg/mL.

RESUMO Objetivo Analisar a efetividade microbiológica considerando a correlação farmacocinética/farmacodinâmica de vancomicina em crianças e propor uma estimativa de ajuste na dose. Métodos Trata-se de um estudo observacional, transversal, realizado em hospital pediátrico, no período de 1 ano (2016 a 2017). Foram incluídas crianças de 2 a 12 anos de ambos os sexos, tendo sido excluídas crianças queimadas ou submetidas à terapia renal substitutiva. Para análise farmacocinética, foram coletadas duas amostras de 2mL de sangue total, respeitando o intervalo de 2 horas entre cada coleta. Resultados Foram incluídos dez pacientes pediátricos com idade de 5,5 anos (mediana) e intervalo interquartil (IQ) de 3,2-9,0 anos, peso de 21kg (mediana; IQ: 15,5-24,0kg) e altura de 112,5cm (mediana; IQ: 95-133cm). Apenas uma criança alcançou concentrações mínimas entre 10µg/mL e 15µg/mL. Conclusão A utilização empírica de vancomicina na população de crianças não alcançou o alvo farmacocinético/farmacodinâmico terapêutico para concentração inibitória mínima de 1μg/mL.

Prevalence and antimicrobial susceptibility profile of microorganisms in a university hospital from Vitória (ES), Brazil / Prevalência de microrganismos e perfil de suscetibilidade antimicrobiana em um hospital universitário de Vitória (ES), Brasil

ABSTRACT INTRODUCTION: Healthcare associated infections (HAIs) occur during the hospital stay as a result of underlying morbidity, invasive procedures, acute pathology or medical treatment. They lead prolonged stay and, consequently, to an increase in financial charges. The main tool to control these infections is the use of antimicrobials. However, the increase in resistance and the low frequency of discovery of new drugs justify the research that evaluates the resistance profile of microorganisms to antimicrobials. OBJECTIVE: To evaluate the prevalence and antimicrobial susceptibility profile of HAIs at a philanthropic reference hospital in Espírito Santo, Brazil. METHODS: Observational, retrospective and cross-sectional study, between July 2014 and June 2016. Data on blood, urine and corporal secretions culture were collected from the data base of the Hospital Infection Control Commission. RESULTS: There was a high prevalence of HAIs in patients older than 60 years. Two hundred and forty three (47.55%) patients were female. The four most prevalent bacteria were: Acinetobacter spp., Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus. Polymyxin was the drug which presented the best antimicrobial effects. CONCLUSION: Polymyxin was active in vitro against all isolates of Acinetobacter spp. Regarding K. pneumoniae, both polymyxin and amikacin showed a significant effectiveness. Regarding Pseudomonas aeruginosa, polymyxin was effective in all samples. Regarding S. aureus, teicoplanin, daptomycin and vancomycin were effective in all samples. Polymyxin showed a good overall in vitro activity.

RESUMO INTRODUÇÃO: As infecções relacionadas com a assistência à saúde (IRAS) ocorrem durante a internação como resultado de morbidade subjacente, procedimentos invasivos, patologia aguda ou tratamento médico. Elas levam à prolongada permanência e, consequentemente, à carga econômica. A principal ferramenta para conter essas infecções são os antimicrobianos. No entanto, o aumento da resistência e a baixa taxa de descoberta de novos medicamentos justificam a pesquisa que avalia o perfil de resistência de microrganismos aos antimicrobianos. OBJETIVO: Avaliar a prevalência e o perfil de suscetibilidade antimicrobiana das IRAS ocorridas em um hospital filantrópico de referência do Espírito Santo, Brasil. MÉTODOS: Estudo observacional, retrospectivo e transversal, entre julho de 2014 e junho de 2016. Os dados sobre cultura de sangue, urina e secreções corporais foram coletados da base de dados do Centro de Controle de Infecção Hospitalar. RESULTADOS: Houve alta prevalência de IRAS em pacientes com mais de 60 anos. Duzentos e quarenta e três (47.55%) pacientes eram do sexo feminino. As quatro bactérias mais prevalentes foram: Acinetobacter spp., Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa e Staphylococcus aureus. A polimixina foi a droga que apresentou os melhores efeitos antimicrobianos. CONCLUSÃO: A polimixina foi ativa in vitro contra todos os isolados de Acinetobacter spp. Quanto à K. pneumoniae, tanto a polimixina quanto a amicacina apresentaram eficácia significativa. Em relação à Pseudomonas aeruginosa, a polimixina foi efetiva em todas as amostras. Já em relação ao S. aureus, teicoplanina, daptomicina e vancomicina foram efetivas em todas as amostras. A polimixina demonstrou um bom desempenho geral in vitro.

Efeito de flavonoides sobre microrganismos de interesse endodôntico e sua influência na expressão de marcadores de mineralização / Effect of flavonoids on endodontic microorganisms and their influence on the expression of mineralization markers

O tratamento endodôntico de dentes permanentes jovens representa um grande desafio clínico devido a presença de paredes dentinárias finas, divergentes ou paralelas e ápice aberto, o que dificulta a desinfecção e a execução dos procedimentos convencionais. Terapias de regeneração endodôntica envolvem o uso de materiais capazes de promover uma desinfecção eficaz sem causar citotoxicidade, além de induzir a diferenciação de células-tronco ou bioestimular células remanescentes do tecido pulpar mesmo após a injúria. Nesse contexto, os flavonoides, polifenóis presentes em frutas e vegetais, poderiam ser agentes interessantes para o tratamento endodôntico de dentes imaturos devido a sua amplitude terapêutica. Dessa forma, o objetivo do presente trabalho foi avaliar o efeito antimicrobiano, citotóxico e indutor de mineralização de flavonoides com finalidade de aplicação endodôntica. Este trabalho de tese foi dividido em três capítulos. O capítulo 1 avaliou a toxicidade dos flavonoides taxifolina, crisina, pinocembrina e galangina sobre fibroblastos pelo ensaio de MTT, a atividade antimicrobiana pela determinação da concentração inibitória e bactericida mínima, e a ação antibiofilme do flavonoide com melhor efeito antimicrobiano, por meio de ensaios em placas de poliestireno e em dentina radicular bovina por meio da análise por microscopia confocal. Os resultados mostraram que o flavonoide taxifolina não foi tóxico para os fibroblastos em nenhuma das concentrações analisadas, enquanto que os flavonoides crisina, pinocembrina e galangina apresentaram efeitos citotóxicos. Crisina, pinocembrina e galangina não apresentaram efeito antimicrobiano frente E. faecalis and S. mutans nas concentrações testadas. A taxifolina foi capaz de inibir todas as bactérias testadas, eliminar biofilmes de E. faecalis e S. mutans em placas de poliestireno e reduzir significantemente o biofilme de E. faecalis em túbulos dentinários. O capítulo 2 avaliou a citotoxicidade do flavonoide taxifolina e o seu potencial sobre a indução de marcadores de mineralização dentinária (produção de fosfatase alcalina - ALP, nódulos de mineralização ­ NM e expressão dos genes DSPP ­ sialofosfoproteína dentinária e DMP-1 ­ proteína da matriz dentinária - 1) em células semelhantes a odontoblastos MDPC-23, após tratamentos de 24, 72h e contínuo. A taxifolina não apresentou citotoxicidade em nenhum dos três tipos de tratamento analisados. Todas as concentrações do tratamento de 24h e as concentrações de 10 e 5µM do tratamento de 72h aumentaram a atividade de ALP. A formação de NM aumentou com os tratamentos de taxifolina à 10µM em ambos os tratamentos de 24 e 72h, e à 5µM no tratamento de 24h. A expressão de DMP-1 aumentou com o tratamento de taxifolina em ambos os tratamentos de 24 e 72h, enquanto que a de DSPP aumentou apenas com o tratamento de 72h na concentração de 5µM. O capítulo 3 avaliou a citotoxicidade da taxifolina, e o seu potencial sobre a indução de marcadores de mineralização óssea (ALP, NM e expressão dos genes ALP e colágeno 1 - Col-1) em células semelhantes a osteoblastos Saos-2, após tratamentos de 24, 72h e contínuo. Os resultados mostraram que os tratamentos com taxifolina nas concentrações de 10, 5 e 1µM não foram citotóxicos em nenhum dos períodos analisados. O tratamento de 72h da taxifolina à 10µM foi capaz de aumentar a atividade de ALP e a formação de NM, além de aumentar a expressão de Col-1 após 13 dias. O tratamento de 24h da taxifolina na concentração de 10µM aumentou a expressão de ALP após 6 dias. Conclui-se que a taxifolina é um flavonoide com potencial uso para o tratamento endodôntico de dentes permanentes jovens, devido à sua ação antimicrobiana/antibiofilme, baixa citotoxicidade e capacidade de estimular a mineralização em odontoblastos e osteoblastos(AU)

The endodontic treatment of young permanent teeth represents a great clinical challenge due to the presence of thin, divergent or parallel dentin walls and the open apex that makes it difficult to disinfect and perform conventional endodontic procedures. Endodontic regeneration therapies involve the use of materials capable of promoting effective disinfection without causing cytotoxicity, in addition to inducing differentiation of stem cells or biostimulating remaining pulp tissue cells even after injury. In this context, the flavonoids, polyphenols present in fruits and vegetables, could be interesting agents for the endodontic treatment of immature teeth due to the wide therapeutic use. Thus, the objective of the present study was to evaluate the antimicrobial, cytotoxic effects and capacity of mineralization induction of flavonoids for endodontic application. This thesis was divided into three chapters. The chapter 1 evaluated the toxicity of taxifolin, chrysin, pinocembrin and galangin flavonoids on fibroblasts by the MTT method, antimicrobial activity by determining the minimum inhibitory and bactericidal concentrations and analyzed the antibiofilm action of the flavonoid with the best antimicrobial effect, by means of the biofilm assays in polystyrene plates and in bovine root dentin and confocal microscopy analysis. The results showed that the flavonoid taxifolin was not toxic on fibroblasts in any tested concentration, while chrysin, pinocembrin and galangin flavonoids showed cytotoxic effects. Chrysin, pinocembrin and galangin showed no antimicrobial effect against E. faecalis and S. mutans in any tested concentrations. Taxifolin was able to inhibit all tested bacteria, to eliminate E. faecalis and S. mutans biofilms on polystyrene plates and significantly reduce E. faecalis biofilms from the dentin tubules. The chapter 2 evaluated the cytotoxicity of taxifolin and its potential on the induction of dentin mineralization markers (alkaline phosphatase production - ALP, mineralization nodules - MN and expression of genes DSPP - dentin sialophosphoprotein and DMP-1 - dentin matrix protein - 1) on odontoblast-like cells MDPC-23, after treatments of 24, 72h and continuous. Taxifolin did not present cytotoxicity at any of the three types of treatments analyzed. All concentrations of 24h-treatment and 10 and 5µM of 72htreatment increased ALP activity. NM formation increased with taxifolin treatments at 10µM in both 24 e 72h treatments, and at 5µM in the 24h-treatment. Expression of DMP-1 increased with taxifolin in both 24 e 72h-treatments, whereas DSPP expression increased only with 72h-treatment at 5µM. The chapter 3 evaluated the cytotoxicity of taxifolin and its potential on the induction of bone mineralization markers (ALP, NM and expression of ALP and collagen 1 -Col-1 genes) on Saos-2 osteoblast-like cells, after treatments of 24, 72h and continuous. The results showed that taxifolin treatments at 10, 5 and 1µM were not cytotoxic in any of the periods analyzed. The 72h-treatment of taxifolin at 10µM was able to increase ALP activity and NM formation, in addition to increasing Col-1 expression after 13 days. The 24h-treatment of taxifolin at 10µM increased ALP expression after 6 days. It is concluded that taxifolin is a flavonoid with potential use for endodontic treatment of young permanent teeth due to its antimicrobial/antibiofilm action, low cytotoxicity and ability to stimulate mineralization in odontoblasts and osteoblasts(AU)

Oral colonization by Candida species in HIV-positive patients: association and antifungal susceptibility study / Colonização oral por espécies de Candida em pacientes HIV positivo: estudo de associação e suscetibilidade antifúngica

ABSTRACT Objective To investigate antifungal susceptibility and factors associated with oral colonization by Candida species in HIV-positive patients. Methods A prospective study based on convenience sampling of subjects recruited from a pool of confirmed HIV-positive individuals seen at a specialty outpatient service in Rondonópolis, Mato Grosso, Brazil). Oral swabs were collected from 197 patients. Candida species were identified by standard microbiological techniques (phenotypic and molecular methods). Antifungal susceptibility was investigated using the broth microdilution method. Results A total of 101 (51.3%) patients were Candida spp carriers. Candida albicans was the most prevalent species (80%). Patients aged 45 to 59 years (Prevalence ratios: 1.90; 95%CI: 1.57-6.31) and 60 years or older (Prevalence ratios: 4.43; 95%CI: 1.57-34.18) were at higher risk of oral colonization by Candida species. Resistance to fluconazole and ketoconazole, or to itraconazole, corresponded to 1% and 4%, respectively. Conclusion Age (45 years or older) was the only factor associated with oral colonization by Candida . Low rates of antifungal resistance to azoles were detected in yeast isolates obtained from HIV-positive patients. Findings of this study may contribute to proper therapeutic selection for oral candidiasis in HIV-positive patients.

RESUMO Objetivo Investigar a suscetibilidade a antifúngicos e os fatores associados à colonização oral por espécies de Candida isoladas de pacientes HIV positivo. Métodos Estudo prospectivo realizado com amostragem por conveniência de indivíduos HIV positivo, acompanhados por um serviço de atendimento especializado da cidade de Rondonópolis, Mato Grosso, Brasil. Foram coletados swabs orais de 197 pacientes. As espécies de Candida foram identificadas por técnicas microbiológicas fenotípicas padrão e por método molecular. A suscetibilidade antifúngica foi determinada pelo método de microdiluição em caldo. Resultados Cento e um (51,3%) pacientes foram colonizados por Candida spp. Candida albicans foi a espécie mais prevalente (80%). Identificou-se um maior risco de colonização oral por espécies de Candida em pacientes com idade entre 45 e 59 anos (razão de prevalência: 1,90; IC95%: 1,57-6,31) e 60 anos ou mais (razão de prevalência: 4,43; IC95%: 1,57-34,18). A resistência ao fluconazol e ao cetoconazol foi de 1% cada e de 4% ao itraconazol. Conclusão O único fator associado à colonização oral por espécies de Candida foi ter 45 anos ou mais. Identificamos baixa taxa de resistência antifúngica aos azóis entre as leveduras isoladas de pacientes HIV positivo. Estes achados podem contribuir para selecionar o tratamento da candidíase oral em pacientes HIV positivos.

Prevalence and antimicrobial susceptibility profile of ESKAPE pathogens from the Federal District, Brazil / Prevalência e perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos de bactérias do grupo ESKAPE no Distrito Federal, Brasil

ABSTRACT Introduction: The leading cause of hospital-acquired infections are the pathogens named by the acronym ESKAPE, which are the initials for the following bacterial: Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumanni, Pseudomonas aeruginosa and Enterobacter spp., which have high resistance rates by escaping the action of the antimicrobial. Objective: To trace the antimicrobial susceptibility profile of the ESKAPE pathogens in a primary public hospital in the Federal District, Brazil. Methods: A cross-sectional, retrospective and descriptive study was conducted by analyzing the corresponding data from January 2010 to December 2015 of samples considered positive to ESKAPE pathogens in order to generate an antimicrobial susceptibility profile. Results: Analyzing the Gram-positive bacteria, almost 80% of E. faecium strains were vancomycin-resistant enterococci (VRE) and almost 40% of S. aureus strains were methicillin (oxacillin)-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). It was observed that gram-negative strains (the ESKAPE group) examined in this study have a higher resistance rate to carbapenems than in other studies. In the molecular analysis, four Klebsiella pneumoniae strains were positive to blaKPC gene, three strains to blaNDM and one Acinetobacter baumanni strain was positive to blaOXA-23 gene. Conclusion: Studies such as this should be performed periodically in order to evaluate the bacterial susceptibility profile. They demonstrate the importance of implementing strategies to prevent hospital-acquired infections, as well as greater antibiotic prescribing control.

RESUMO Introdução: Os principais patógenos causadores de infecções nosocomiais foram resumidos pela sigla ESKAPE, que são as iniciais das seguintes bactérias: Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumanni, Pseudomonas aeruginosa e Enterobacter spp., as quais possuem altas taxas de resistência por conseguirem escapar das ações dos antimicrobianos. Objetivo: Traçar o perfil de suscetibilidade antimicrobiana do grupo ESKAPE em um hospital primário da rede pública do Distrito Federal, Brasil. Métodos: Foi realizado um estudo transversal, retrospectivo e descritivo, analisando os dados correspondentes de janeiro de 2010 a dezembro de 2015 para as amostras consideradas positivas para o grupo ESKAPE, com o intuito de gerar um perfil de sensibilidade aos antimicrobianos. Resultados: Ao analisar bactérias Gram positivas, quase 80% das cepas de Enterococcus faecium foram resistentes à vancomicina (VRE) e cerca de 40% das cepas de Staphylococcus aureus, resistentes à oxacilina (MRSA). Nas bactérias do grupo ESKAPE, observaram-se cepas com uma taxa de resistência maior aos carbapenens do que em outros estudos. Ao realizar uma análise molecular, quatro cepas de Klebsiella pneumoniae foram positivas para o gene blaKPC e três, para o blaNDM; uma de Acinetobacter baumanni foi positiva para o gene blaOXA-23. Conclusão: Estudos como este devem ser realizados periodicamente de modo a avaliar o perfil de suscetibilidade das bactérias. Eles demonstram a importância do uso de estratégias para evitar infecções nosocomiais, bem como um maior controle na prescrição de antimicrobianos.

Atividade antimicrobiana do cimento à base de silicato de cálcio acrescido de antibióticos, testada pelos métodos de difusão radial e concentração inibitória mínima / Antimicrobial activity of calcium silicate-based sealer containing antibiotics, tested by means of radial diffusion and minimum inhibitory concentration

Introdução: a substituição do MTA pelo cimento Portland tem sido recomendada pela semelhança em suas composições e propriedades físicas e biológicas. A adição de um antibiótico ao cimento promoveria vantagens clínicas, desde que esse fosse liberado antes e após a presa do cimento. Objetivo: avaliar a atividade antimicrobiana, pelos métodos da difusão e concentração inibitória mínima (CIM), do cimento Portland puro e acrescido de radiopacificador, adicionado de amoxicilina e ciprofloxacina, frente a cinco microrganismos: S. aureus, P. aeruginosa, E. coli, E. faecalis e C. albicans. Métodos: no teste de difusão, foram utilizadas 30 placas de Petri com ágar, escavadas com poços onde foram introduzidos os cimentos imediatamente após a manipulação e após presa de 24h. Para o teste de CIM, foram preparados 120 tubos de ensaio, contendo 10mL de caldo BHI, divididos em quatro grupos. Cada grupo foi semeado com um inóculo fresco de cada microrganismo, separadamente. Os tubos foram incubados em estufa a 37°C e a turbidez foi avaliada após 24h. Os resultados foram avaliados pela análise de variância ANOVA e a comparação dos grupos, pelo teste de Tukey, com significância de 5%. Resultados: o cimento Portland apresentou atividade antimicrobiana apenas contra C. albicans. A amoxicilina apresentou um tênue efeito antibacteriano, enquanto a ciprofloxacina inibiu o crescimento bacteriano em todas as concentrações testadas. Conclusão: a adição da ciprofloxacina ao cimento Portland a fim de incrementar a atividade antimicrobiana parece segura; entretanto, os resultados não sustentam sua aplicação clínica, sendo necessários novos estudos.